Epidemiology of Candidemia at a University Hospital in Colombia, 2008-2014 / Epidemiología de los casos de candidemia en un hospital universitario en Colombia, 2008-2014

Introducción: Candida spp. es una levadura comensal de la microbiota humana. Por características del hospedero, las infecciones del torrente sanguíneo pueden aparecer y causar una gran morbimortalidad. Métodos: Estudio restrospectivo transversal analítico de los cultivos positivos para Candida spp. entre 2008 y 2014 en un hospital universitario en Bogotá, Colombia. Se evaluaron las características clínicas y microbiológicas presentes previo a la toma de la primera muestra de sangre positiva y se determinaron asociaciones con infecciones por especies no C. albicans (NCA). Resultados: Se incluyeron 123 casos de candidemia. C. albicans fue la especie más aislada (42 %). Sin embargo, las especies NCA como grupo fueron observadas más frecuentemente. Más del 70 % de los casos presentaron manejo en la unidad de cuidado intensivo, con una mediana de estancia de 14 días previo a la primera muestra de sangre positiva. Se detectaron numerosas características médicas; sin embargo, ninguna estuvo asociada con candidemia por especies NCA. Se observó resistencia a por lo menos un antifúngico en el 29 % de los casos, aunque en una muestra reducida de pruebas de sensibilidad. Conclusiones: Nuestros resultados sustentan el viraje mundial hacia la candidemia por especies NCA; pero no encontramos asociaciones clínicas en este grupo. Debe dársele prioridad a la identificación de factores de riesgo y a la optimización de los puntajes de predicción, que permitan identificar pacientes en riesgo que se beneficien de terapia preventiva.

Introduction: Candida species are commensal yeasts of the human microbiota. However, due to several host's conditions, bloodstream infections may arise causing high morbimortality. Methods: Retrospective cross-sectional analytical study of positive blood cultures for Candida spp. between 2008'2014 at a university hospital in Bogotá. Colombia. We evaluated clinical and microbiological characteristics prior to the first positive blood sample was obtained and determined associations with non'C. albicans (NCA) species infections. Results: We included 123 candidemia cases. C. albicans was the most frequently isolated species (42%). However; NCA species as a group were observed more often. Over 70% of cases were managed at the ICU, with a median stay of 14 days. Several medical factors were frequently observed, however none appeared to be associated with NCA species candidemia. Resistance to at least one antifungal agent was observed in 29% of cases, although a reduced sample of susceptibility tests was available. Conclusions: Our results support a worldwide shift towards NCA candidemia. However, clinical features were not associated with NCA infections. The identification of risk factors and the improvement of prediction scores must be prioritized, in order to identify' patients at high risk who may benefit of pre-emptive therapy.

FRECUENCIA DE LA COLONIZACIÓN POR PNEUMOCYSTIS JIROVECII EN PACIENTES CON ENFERMEDAD PULMONAR OBSTRUCTIVA CRÓNICA EN BOGOTÁ, COLOMBIA / Pneumocystis jirovecii colonization frequency in Chronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD) patients in Bogota, Colombia

Antecedentes: la colonización por Pneumocystis jirovecci (P. jirovecii) se ha postulado como causa de deterioro de la función pulmonar en pacientes con Enfermedad Pulmonar Obstructiva Crónica (EPOC). Se desconocía la frecuencia de aparición de la colonización por P. jirovencii en esa población en Colombia. Objetivo: documentar la frecuencia de colonización por P. jirovecii en mayores de 40 años con EPOC excluyendo a los pacientes que requirieran manejo inmunosupresor y a las personas infectadas por el Virus de la Inmunodeficiencia Humana (VIH). Materiales y métodos: se trató de un estudio de corte transversal, que contó con muestreo no probabilístico por conveniencia y selección continua de pacientes. Se realizó PCR (reacción en cadena de polimerasa) en tiempo real (rt-PCR) del esputo inducido con el Kit LighMix de P. jirovecii (Roche®-Suiza) amplificándose un fragmento de 244 pares de bases a partir del gen de la glicoproteína de superficie del hongo. Resultados: para una muestra de 52 pacientes en total, se documentó una frecuencia de colonización del 15,4% en todos los participantes mayores de 65 años, quienes además presentaron altos índices de sintomatología según la escala modificada Medical Research Council (MR Cm) y el cuestionario de evaluación de la EPOC (CAT). La mayoría de pacientes analizados se clasificó como GOLD D (63%) en la clasificación por la Iniciativa Global para la EPOC. Conclusiones: la frecuencia de colonización por P. jirovecii en pacientes con EPOC detectada por rt-PCR en el esputo inducido fue del 15,4%. Este constituye el primer estudio colombiano que evalúa la frecuencia de colonización del hongo.

Background: Pneumocystis jirovecii colonization has been proposed as the explanation for lung function decline in patients with Chronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD). The colonization frequency due to Pneumocystis jirovecii in this group of patients was yet unknown in Colombia. Objective: To document the frequency of colonization in patients over 40 years old with COPD diagnosis. The study excludes patients who require immunosuppressive treatment and who are infected with Human Immunodeficiency Virus (HIV). Materials and methods: A cross-sectional study was held, using non-probabilistic convenience sampling with continuous patient selection. Real time PCR (rt-PCR) of P. jirovecii was performed in an induced sputum sample, the fragment of 244 base pairs from the major surface glycoprotein gene of the fungus was amplified using the LighMix Kit (Roche®-Switzerland). Results: From the sample of 52 patients, we found a frequency of colonization of 15.4%. All colonized patients were over 65 years old with high symptomatology levels according to the modified Medical Research Council scale (MRCm), and the COPD Evaluation Test (CAT). Most of the colonized patients were classified as GOLD D (63%), as rated by the Global Initiative for COPD. Conclusions: The colonization frequency due to P. jirovecii in COPD patients detected by rt-PCR in induced sputum was 15.4%. This is the first study to assess the frequency of P. jirovecii colonization in Colombia.

Zigomicosis / Zygomycosis

Las zigomicosis son infecciones fúngicas graves e inusuales, causadas por hongos ubicuos pertenecientes a la clase Zigomicetos, los cuales están subdivididos en dos órdenes: Mucorales y Entomoftorales. Las infecciones causadas por los Mucorales se caracterizan por su rápida evolución, con destrucción tisular e invasión de vasos sanguíneos. Se presentan en hospederos con factores de riesgo definidos, entre los que se incluyen alteraciones funcionales o cuantitativas de los neutrófilos, acidosis metabólica o aumento en los niveles séricos de hierro. Sus manifestaciones clínicas se dividen en rinocerebral, pulmonar, cutánea, gastrointestinal y diseminada. El principal mecanismo de infección es la vía inhalatoria, seguida por la mecánica por lesiones dérmicas. Tienen un curso clínico agresivo y a su vez inespecífico que usualmente pone en peligro la vida del paciente, por lo que se debe tener un alto índice de sospecha en aquellas personas con cuadro clínico sugestivo y factores de riesgo, para iniciar tratamiento agresivo temprano con antifúngicos y cirugía.

Zygomycosis are severe and uncommon fungal infections caused by ubiquitous fungi members of the class zygomicetes, which are subdivided into two orders: Mucorales and Entomophtorales. Infections due to Mucorales are characterized by a rapid evolution along with a wide tissue destruction and direct invasion of blood vessels. These diseases are seen in individuals with clearly defined risk factors such as quantitative or qualitative neutrophil defects, metabolic acidosis, or elevated iron serum levels. The clinical forms of these diseases are divided into new categories: Rhinocerebral, pulmonary, cutaneous, gastrointestinal, and disseminated infections. The main mechanism of infection is by inhalation, but it is also possible to acquire the infection by direct inoculation into the dermis. The clinical course is aggressive but unspecified and usually threatens patients' survival; therefore, we must have a high index of suspicion in those cases with a suggestive clinical scenario and risk factors in order to perform a timely and aggressive intervention with antifungal therapy and surgery.